La Fundación Foro Nacional por Colombia está integrada por dos Capítulos Regionales, los cuales son entidades con personería jurídica, autonomía jurídica, relativa autonomía financiera, patrimonio propio y formas propias de gobierno. Tienen como función principal desarrollar las políticas y los programas de la fundación en distintas regiones del país.

Participan con un(a) delegado(a) en la Asamblea Nacional de Miembros y en el Consejo Ejecutivo de la Fundación. La presidencia ejecutiva tiene derecho a participar en las Asambleas de Socios de los Capítulos Regionales.